SPSSとRの分散分析結果が違うことについて調べていたら、UCLAでまとめられていました。コードを紹介します。
http://www.ats.ucla.edu/stat/mult_pkg/whatstat/
コードの紹介
理論は他のサイトを参考にしてください。下記コードでSPSSと同じ結果を算出することができます。
#一元配置分散分析
hsb2 <- read.table("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/hsb2.csv", sep = ",", header = T)
library(car)
Anova(lm(write ~ factor(ses), contrasts = list(ses = contr.sum), data = hsb2), type = 3)
Anova(lm(write ~ factor(ses), data = hsb2), type = 2)
summary(aov(lm(write ~ factor(ses), data = hsb2)))
########################################
#二元配置分散分析
exer <- read.csv("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/exer.csv")
exer <- within(exer, {
diet <- factor(diet)
exertype <- factor(exertype)
time <- factor(time)
id <- factor(id)
})
exertype.aov <- aov(pulse ~ exertype * time + Error(id), data = exer)
summary(exertype.aov)
[/code]
少しでも、あなたのウェブや実験の解析が楽になりますように！！