「 xml 」 一覧

Rで解析:PubMedでの情報収集が簡単です「easyPubMed」パッケージ

NCBIデータベースをRから操作するパッケージはいくつか存在しますが、本パッケージはPubMedデータベースから情報を収集するのに特化したパッケージです。 操作が非常に簡単なので、すぐに使いこなすこと ...

Rでコマンド:「XML」パッケージでxlsxファイルを読み込むコマンド例

docxファイルやxlsxファイルはxlmファイル群をzipで圧縮した構造です。解凍してしまえばXMLパッケージで読み込むことができます。そこで、XMLパッケージの利用例としてxlsxファイルを読み込 ...

Rで遺伝子網羅解析:PubMedのエビデンスを利用して抽出

マイクロアレイで発現変動を示した遺伝子の中からPubMedから入手したエビデンスリストに含まれる遺伝子を抽出するコードを作成しました。ご紹介します。 解析の前準備 Rの導入についてはこちらから。 XM ...

Rでウェブ解析:便利!Rで読み込むxmlファイル

PubMedは文献検索サイトで検索結果をxmlで出力できます。xmlはRで編集が可能なので、PubMed検索結果のxmlから論文タイトルとアブストラクトを読み込み、タグプロットと単語の出現数をまとめた ...

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