Rで解析:データの要約に便利かも「ezsummary」パッケージ

データの要約は面倒な作業です。特に、2列に分かれているデータをA(a)のように1列で表現したい時は処理コマンドを工夫しなくてはなりません。

コマンドの工夫が面倒な方へ、データを要約を目的にした「ezsummary」パッケージから、データを1列にA(a)などと表示が可能なezmarkupコマンドをオススメします。

パッケージバージョンは0.1.9。実行コマンドはR version 3.2.2で確認しています。

パッケージのインストール

下記、コマンドを実行してください。

#パッケージのインストール
install.packages("ezsummary")

実行コマンド

ezmarkupコマンドの他に、参考としてデータ要約のコマンドも紹介します。詳細はコメント、パッケージのヘルプを確認してください。

###データ例の作成#####
n <- 100
TestData <- data.frame(Group = sample(paste0("Group", 1:10), n, replace = TRUE),
                       Data1 = sample(1:100, n, replace = TRUE),
                       Data2 = rnorm(n),
                       Data3 = sample(1:100, n, replace = TRUE),
                       Data4 = sample(1:100, n, replace = TRUE))
########

#データの列をまとめる:ezmarkuコマンド
#まとめ方を指定:patternオプション;"."が列を示します,[]で列をまとめます
MarkData <- ezmarkup(TestData, pattern = ".[.(.)][.(.)]")
head(MarkData)
Group           Data1(Data2) Data3(Data4)
1  Group8 11(-0.892586596231018)       23(70)
2  Group8   12(-1.5541961046788)       42(44)
3  Group5  62(0.509548680240374)       36(67)
4 Group10   18(1.11331361886136)       46(78)
5  Group1 89(-0.396595786892319)        7(54)
6  Group7   6(-1.70261354673421)       83(16)

####おまけ#####
#データの要約:ezsummaryコマンド
ezsummary(TestData, n = FALSE, sem = FALSE, median = FALSE,
          quantile = FALSE, round.N = 3,
          flavor = "long", unit_markup = NULL)
Source: local data frame [199 x 3]
variable mean_n  sd_p
(chr)  (chr) (dbl)
1   Group_Group1      6  0.06
2  Group_Group10     13  0.13
3   Group_Group2     12  0.12
4   Group_Group3      7  0.07
5   Group_Group4     11  0.11
6   Group_Group5      7  0.07
7   Group_Group6     13  0.13
8   Group_Group7      9  0.09
9   Group_Group8     13  0.13
10  Group_Group9      9  0.09
..           ...    ...   ...

#データを列毎に要約:ezsummary_quantitativeコマンド
ezsummary_quantitative(TestData, n = FALSE, mean = TRUE, sd = TRUE,
                       sem = FALSE, median = FALSE, quantile = FALSE, round.N = 3,
                       flavor = "long", unit_markup = NULL)
Source: local data frame [5 x 3]
variable   mean     sd
(fctr)  (dbl)  (dbl)
1    Group     NA  2.845
2    Data1 50.090 30.512
3    Data2  0.023  1.027
4    Data3 54.780 27.881
5    Data4 51.310 26.330

少しでも、あなたの解析が楽になりますように!!

Prices and shipping availability may change. Please refer to the product page at time of purchase.
Content displayed on this site is provided by Amazon and may be updated or removed.
Amazon Associate, karada-good earns income through qualifying sales.
タイトルとURLをコピーしました