Rで解析:データのヒートマップ化が簡単「paintmap」パッケージ

Rの解析に役に立つ記事
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データのヒートマップ作成が簡単なパッケージの紹介です。

パッケージバージョンは1.0。windows 7およびOS X 10.11.5のR version 3.3.1で確認しています。

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パッケージのインストール

下記コマンドを実行してください。

#パッケージのインストール
install.packages("paintmap")

実行コマンド

詳細はコマンド、パッケージのヘルプを確認してください。

#パッケージの読込
library("paintmap")

###データ例の作成#####
PlotData <- matrix(sample(c(TRUE, FALSE), 50, replace = TRUE), 10, 5,
                   dimnames = list(paste0("Data", 1:10), paste0("Group", 1:5)))
#####

#&#12487;&#12540;&#12479;&#12363;&#12425;&#33394;&#12467;&#12540;&#12489;&#37197;&#21015;&#12434;&#20316;&#25104;:color_matrix&#12467;&#12510;&#12531;&#12489;
#logical&#12394;&#12487;&#12540;&#12479;&#12434;&#20363;&#12395;&#12375;&#12390;&#12356;&#12414;&#12377;&#12364;&#25968;&#20516;&#12487;&#12540;&#12479;&#12418;&#20966;&#29702;&#21487;&#33021;&#12391;&#12377;
#&#33394;&#12434;&#25351;&#23450;:colors&#12458;&#12503;&#12471;&#12519;&#12531;;&#21021;&#26399;&#20516;:heat.colors(10)
ColMatrix <- color_matrix(PlotData,
                          colors = colorRampPalette(c("#a87963", "#4b61ba"))(5))

#&#33394;&#12467;&#12540;&#12489;&#37197;&#21015;&#12434;&#12503;&#12525;&#12483;&#12488;:paintmap&#12467;&#12510;&#12531;&#12489;
paintmap(ColMatrix)

出力例

・paintmapコマンド

paintmap

少しでも、あなたのウェブや実験の解析が楽になりますように!!

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