Rで解析:データ全体とグループの傾向把握に役に立ちます「wrightmap」パッケージ


データ全体とグループの傾向を図式化して把握するのに便利なパッケージの紹介です。使用して良さが理解出来るパッケージです。なお、RStudioでは図式化が上手くいきません。ぜひ、R単独で実行してみてください。

図から傾向を把握するのに初めは戸惑うかもしれません。でも、慣れると様々な役に立つと思います。

パッケージバージョンは1.2。実行コマンドはwindows 7およびOS X 10.11.2のR version 3.2.3で確認しています。


パッケージのインストール

下記、コマンドを実行してください。

#パッケージのインストール
install.packages("devtools")
devtools::install_github("david-ti/wrightmap")

実行コマンド

詳細はコメント、パッケージのヘルプを確認してください。

#パッケージの読み込み
library("WrightMap")

###データ例の作成#####
n <- 10
TestData <- data.frame(Data1 = sample(1:700, n, replace = TRUE),
                       Data2 = sample(400:800, n, replace = TRUE),
                       Data3 = sample(3:300, n, replace = TRUE))
########

###シンボル色用データの作成#####
#色の指定
Cols <- c("blue", "red", "green")
#作成
ColSetData <- matrix(rep(Cols, nrow(TestData)), byrow = TRUE, ncol = ncol(TestData))
########

###シンボル種類用データの作成#####
#種類の指定
Pchs <- c(18, 22, 21)
#作成
PchsSetData <- matrix(rep(Pchs, nrow(TestData)), byrow = TRUE, ncol = ncol(TestData))
########

###グラフのプロット:wrightMapコマンド#####
####
###右グラフの設定#####
####
#種類:item.sideオプション;itemModern,itemHistの設定が可能
#横幅:item.propオプション
#シンボル色:thr.sym.col.bg,thr.sym.col.fgオプション
#シンボルサイズ:thr.sym.cexオプション
#シンボル種類:thr.sym.pchオプション
#x軸ラベル角度を調整:label.items.srtオプション
#x軸ラベルを階段表示:label.items.rowsオプション
####
###左グラフの設定#####
####
#種類:person.sideオプション;personHist,personDensの設定が可能
#ラベル:dim.namesオプション
#色:dim.colorオプション
###グラフの体裁#####
#タイトル:main.titleオプション

###プロット#####
wrightMap(thetas = TestData, thresholds = NULL,
          ###右グラフの設定#####
          item.side = "itemModern",
          item.prop = 0.5,
          thr.sym.col.bg = ColSetData,
          thr.sym.col.fg = ColSetData,
          thr.sym.cex = 2,
          thr.sym.pch = PchsSetData,
          label.items.srt = 0,
          label.items.rows = 3,
          ###左グラフの設定#####
          person.side = "personHist",
          dim.names = colnames(TestData),
          dim.color = Cols,
          ###グラフの体裁#####
          main.title = "TEST PLOT")

出力例

wrightmap


少しでも、あなたのウェブや実験の解析が楽になりますように!!

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