Rでお遊び:変わったプロットfishPlotの「fishiplot」パッケージ


かなり変わったfishplot作成のパッケージです。使い方、親子関係を指定するベクトルParentsの謎を解き明かしながら使用してください。

パッケージバージョンは0.1。実行コマンドはwindows 7およびOS X 10.11.2のR version 3.2.4で確認しています。


パッケージのインストール

下記、コマンドを実行してください。

#パッケージのインストール
install.packages(c("Hmisc","plotrix","png"))
install.packages("devtools")
devtools::install_github("chrisamiller/fishplot")

実行コマンド

詳細はコメント、パッケージのヘルプを確認してください。

#パッケージの読み込み
library("fishplot")
#時系列データの作成
TimePoints <- c(0,30,75,150) #プロットデータの作成 PlotData <- matrix(c(100, 45, 00, 00, 02, 00, 00, 00, 02, 00, 02, 01, 98, 00, 95, 40), ncol = length(TimePoints)) #親子関係を指定するベクトル Parents <- c(0,1,1,3) ######## #FishPlotデータの作成:createFishObjectコマンド FishPlotData <- createFishObject(PlotData, Parents, TimePoints) #FishPlotデータに描写領域を付与:layoutClonesコマンド FishPlotData <- layoutClones(FishPlotData) #FishPlotを描写:fishPlotコマンド #線の引き方を指定:shapeオプション;"spline","polygon","bezier"が指定可能 #データ毎の枠線の色:borderCol fishPlot(FishPlotData, shape = "spline", title.btm = "TEST", borderCol = "blue", cex.title = 0.5, vlines = c(0,150), vlab = c("day 0","day 150")) #例えばデータ毎の塗色を変える場合 FishPlotData@col <- c("blue", "green", "yellow", "black") [/code]


出力例

・fishPlotコマンド
fishplot


少しでも、あなたのウェブや実験の解析が楽になりますように!!

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