からだにいいもの Rで解析：データの操作に便利です！！「berryFunctions」パッケージ
データの操作に便利なコマンドが収録されているパッケージの紹介です。多くのコマンドが収録されています。その中から目についたコマンドの紹介です。
有益なパッケージです。ヘルプまたは公式ページも参考にしてください。
・berryFunctionsの紹介ページ
https://cran.r-project.org/web/packages/berryFunctions/vignettes/berryFunctions.html
パッケージバージョンは1.21.14。R version 4.2.2で動作を確認しています。
パッケージのインストール
下記コマンドを実行してください。
#パッケージのインストール
install.packages("berryFunctions")スポンサーリンク
実行コマンド
詳細はコマンド、パッケージのヘルプを確認してください。なお、実行コマンド内のseqPalコマンドに収録されているパレットはshowPal()と実行することで確認することができます。ぜひ試してみてください。
#パッケージの読み込み
library("berryFunctions")
###データ例の作成#####
n <- 200
TestData <- data.frame("Group" = sample(paste0("Group", 1:5), n, replace = TRUE),
"Data1" = sample(1:50, n, replace = TRUE),
"Data2" = sample(1:35, n, replace = TRUE),
"Data3" = sample(1:10, n, replace = TRUE))
########
#統計量によるグラデーション付の散布図:colPointsコマンド
#x軸の項目を設定:xオプション
#y軸の項目を設定:yオプション
#統計量を設定:zオプション
#x軸ラベルを設定:xlabオプション
#y軸ラベルを設定:ylabオプション
#統計量ラベルを設定:zlabオプション
#プロットシンボルを設定:pchオプション;単一文字でも可能
#新規でプロットする場合:addオプション;FALSE
colPoints(x = TestData[, 2], y = TestData[, 3],
z = TestData[, 4], xlab = "テスト1",
ylab = "テスト2", zlab = "点数",
pch = "★", cex = 1.5, legend = TRUE,
add = FALSE, col = seqPal(yr = TRUE))
#matrix classをヒートマップテーブルで表示:tableColValコマンド
#データ例をmatrix classに変換
TableMatrix <- as.matrix(TestData[1:10, 2:4])
rownames(TableMatrix) <- TestData[1:10, 1]
#プロット
#データを指定:matオプション
#塗色を指定:paletteオプション
#行名の幅を指定:nameswidthオプション
#列名の高さを指定:namesheightオプション
tableColVal(mat = TableMatrix,
palette = seqPal(yr = TRUE),
nameswidth = 0.2, namesheight = 0.1)
#グループ毎にデータをプロット:groupHistコマンド
#x軸を指定:xオプション
#グループ分けの指標を指定:gオプション
groupHist(df = TestData, main = "Histogrames of Data1", x = "Data1",
g = "Group", col = seqPal(yr = TRUE))
#文字列前後の無駄な空白を削除:trimwsコマンド
trimws(c(" からだに いいもの ", " I have a PEN ", "I have an apple "))
[1] "からだに いいもの" "I have a PEN" "I have an apple"
#指定した範囲を差分で大きい数からデータを作成:seqRコマンド
seqR(range = c(50, 1), by = -3)
[1] 50 47 44 41 38 35 32 29 26 23 20 17 14 11 8 5 2出力例
・colPointsコマンド
・tableColValコマンド
・groupHistコマンド
・showPal()の実行結果
あなたの解析がとっても楽になりますように！！
スポンサーリンク
