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からだにいいもの

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Rで解析:学術誌やSF風のカラーパレットが収録「ggsci」パッケージの紹介

学術論文やビジネスレポートなどでデータ可視化を行う際、情報の正確さを保ちつつ、洗練された見た目にするための配色選びは意外と難しい課題です。ggsciパッケージは、こうした悩みを解決するために、有名な科学誌やデータ可視化ライブラリ、さらにはSF映画から着想を得た多彩なカラーパレットが収録されています。

パッケージバージョンは5.0.0。Windows 11 x64 (build 26200)のR version 4.6.0で確認しています。

パッケージのインストール

下記コマンドを実行してください。

# パッケージのインストール
install.packages("ggsci")
# パッケージの読み込み
library("ggsci")

# カラーパレットの表示に便利な「scales」パッケージ
# install.packages("scales")
library("scales")
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コマンド例

詳細はコメント、パッケージのヘルプを確認してください。

AAAS journalのカラーパレット:pal_aaasコマンド

# AAAS journalのカラーパレット:pal_aaasコマンド
# paletteオプション:パレットのタイプを指定;初期値c("default")
# alphaオプション:透明度のレベルを指定;初期値1
show_col(pal_aaas("default"), alpha = 1)
ggsciのpal_aaas() のグラフ

Lancet journalのカラーパレット:pal_lancetコマンド

# Lancet journalのカラーパレット:pal_lancetコマンド
# paletteオプション:パレットのタイプを指定;初期値c("lanonc")
# alphaオプション:透明度のレベルを指定;初期値1
show_col(pal_lancet("lanonc")) 
ggsciのpal_lancet() のグラフ

COSMIC(Catalogue Of Somatic Mutations in Cancers)のカラーパレット:pal_cosmicコマンド

# COSMIC(Catalogue Of Somatic Mutations in Cancers)のカラーパレット:pal_cosmicコマンド
# paletteオプション:パレットのタイプを指定;初期値c("hallmarks_light", "hallmarks_dark", "signature_substitutions")
# alphaオプション:透明度のレベルを指定;初期値1
show_col(pal_cosmic("hallmarks_light")) 
ggsciのpal_cosmic() のグラフ

Gephiのカラーパレット:pal_gephiコマンド

# Gephiのカラーパレット:pal_gephiコマンド
# paletteオプション:パレットのタイプを指定;"default","fancy_light","fancy_dark","shades"       "tarnish","pastel","pimp","intense","fluo","red_roses","ochre_sand","yellow_lime","green_mint","ice_cube","blue_ocean","indigo_night","purple_wine" 
# alphaオプション:透明度のレベルを指定;初期値1
show_col(pal_gephi("fancy_light"))

iterm2-color-schemes プロジェクト由来のカラーパレット:pal_itermコマンド

# iTermカラーパレット:pal_itermコマンド
# paletteオプション:パレットの名前を指定;iterm_palettes()で確認,551種類あります
# variantオプション:パレットのバリエーションを指定;"normal","bright"
# alphaオプション:透明度のレベルを指定;初期値1
show_col(pal_iterm("Rose Pine"))
show_col(pal_iterm("Japanesque"))

show_col(pal_iterm(“Rose Pine”))のプロット

ggsciのpal_iterm() のグラフ

show_col(pal_iterm(“Japanesque”))のプロット

Atlassian Design Systemのカラーパレット:pal_atlassianコマンド

# Atlassian Design Systemのカラーパレット:pal_atlassianコマンド
# paletteオプション:パレットのタイプを指定;初期値c("categorical8")
# alphaオプション:透明度のレベルを指定;初期値1
show_col(pal_atlassian("categorical8"))
ggsciのpal_atlassian() のグラフ

この記事が誰かの役に立ちますように。

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