Rで解析:要約値箱ひげ図のプロット「lvplot」パッケージ


Descriptionでletter value boxplotと記述があり、要約値箱ひげ図という表現が良いのか悩みます。データ分布を表現する一つの手段で便利な表現方法です。

基本プロットだけでなく「ggplot2」パッケージでも利用することができます。データ分布の確認に便利です。

17.11.20:ggplot2でのコマンド変更に気が付き修正です。

パッケージバージョンは0.2.0.9000。実行コマンドはwindows 10のR version 3.4.2で確認しています。

パッケージのインストール

下記コマンドを実行してください。

#パッケージのインストール
install.packages("devtools")
devtools::install_github("hadley/lvplot")

実行コマンドの紹介

詳細はコマンド内を確認ください。

#パッケージの読み込み
library("lvplot")

#要約値箱ひげ図のプロット:LVboxplotコマンド
par(mfrow=c(4,2), mar=c(3,3,3,3))
for (i in 1:4) {
x <- rexp(10 ^ (i + 1)) boxplot(x, col = "lightblue", horizontal = TRUE) title(paste("rexp, n = ", length(x))) LVboxplot(x, col = "lightblue", xlab = "") } #ggplot2でプロット:geom_lvplotコマンド library("ggplot2") #カラーパレット作製 library("scales") ###プロットデータの作製##### PlotData <- NULL for (i in 1:4) { EXPData <- cbind(i, rexp(10 ^ (i + 1))) PlotData <- rbind(PlotData, EXPData) } PlotData <- as.data.frame(PlotData) ####### ggplot(PlotData, aes(PlotData[, 1], PlotData[, 2])) + geom_lv(aes(fill=..LV..)) + scale_fill_manual(values = seq_gradient_pal(c("#e1e6ea", "#505457", "#4b61ba", "#a87963", "#d9bb9c", "#756c6d", "#807765", "#ad8a80"))(seq(0, 1, length = 14))) + facet_wrap(~i) [/code]


出力例

・LVboxplotコマンド
LVboxplot

・geom_lvコマンド
geom_lvplot


少しでも、あなたのウェブや実験の解析が楽になりますように!!

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