CRANだけでなくbioconductorから導入したパッケージの管理に便利なパッケージの紹介です。なお、Rのバージョン3.3.0以上の環境が必要です。Rのバージョンをあげるチャンスです。
パッケージバージョンは0.0.2。実行コマンドはwindows 7およびOS X 10.11.2のR version 3.3.0で確認しています。
パッケージのインストール
下記コマンドを実行してください。
#パッケージのインストール install.packages("rvcheck")
実行コマンドの紹介
詳細はコマンド、パッケージのヘルプを確認してください。
#パッケージの読み込み library("rvcheck") #bioconductorに登録されているパッケージを確認:check_biocコマンド #パッケージ名を指定:pkgオプション check_bioc("ggtree") ## ggtree is not installed... ## try http:// if https:// URLs are not supported source("https://www.bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("ggtree") $installed_version [1] NA $latest_version [1] "1.4.7" $up_to_date [1] NA #CRANに登録されているパッケージを確認:check_cranコマンド #パッケージ名を指定:pkgオプション #試しにtwitteRをインストールして確認 #‘bit’, ‘jsonlite’, ‘mime’, ‘curl’, ‘openssl’, ‘R6’, ‘bit64’, ‘rjson’, ‘DBI’, ‘httr’ #が同時にインストールされます install.packages("twitteR") #確認 check_cran("twitteR") package is up-to-date release version $installed_version [1] ‘1.1.9’ $latest_version [1] "1.1.9" $up_to_date [1] TRUE #Rのバージョンを確認:check_rコマンド check_r() $installed_version [1] "R-3.3.0" $latest_version [1] "R-3.3.0" $latest_url [1] "https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.3.0.tar.gz" $up_to_date [1] TRUE #インストールしている全てのパッケージをアップデート:update_allコマンド update_all()
少しでも、あなたのウェブや実験の解析が楽になりますように!!